Lezione 14: docking
Authored by Anna MARABOTTI
Biology, Chemistry, Science
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5 questions
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1.
MULTIPLE CHOICE QUESTION
20 sec • 1 pt
Qual è l'applicazione più adatta di un rigid protein docking?
Lo screening rapido di banche dati di grandi dimensioni
L'analisi della variabilità conformazionale della proteina nel complesso
Lo studio della variabilità conformazionale del ligando nel complesso
L'identificazione del sito attivo nel complesso
2.
MULTIPLE CHOICE QUESTION
20 sec • 1 pt
Qual è il vantaggio di un algoritmo di docking incrementale?
Permette di ridurre lo spazio conformazionale da campionare per il ligando
Permette di identificare la conformazione di proteina più adatta per l'interazione
Permette di valutare le interazioni tra proteina e ligando
Nessuna delle altre opzioni è corretta
3.
MULTIPLE CHOICE QUESTION
10 sec • 1 pt
Un force field di tipo knowledge-based può essere usato per valutare l'energia di interazione in un docking?
SI
No
4.
MULTIPLE CHOICE QUESTION
20 sec • 1 pt
Un algoritmo genetico nel docking serve per:
Generare conformazioni del ligando
Generare conformazioni della proteina
Valutare l'energia dell'interazione proteina-ligando
Analizzare le forze di interazione proteina-ligando
5.
MULTIPLE CHOICE QUESTION
20 sec • 1 pt
Quale tra le componenti energetiche di un force field classico non è inclusa in un force field per docking?
Etot
Ebond-P
Enonbond
Ebond-L
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